糊涂的甲方与乙方，造成了清单单价与实际严重不相符，种瓜得瓜，种豆得豆，最后的苦果还得自己吞下去。
招投标一开始，甲乙双方都没有认真的去对待。
面对一项新工艺，大家都不了解，甲方没有进行认真的调研论证，而是简单的编制招标文件。
乙方投标时，面对新工艺，在自己没有确切的把握前提下，随意编制响应文件，对工程是否能够实施，完全没有考虑。
甲方有责任，乙方责任最大。
在实际工作中，招标清单单价与实际不符，也会时常发生，但是这种情况一般不会偏离太大。
由于招标投标是法律规定程序组织实施，招投标的结果具有法律效力。
中标人既然响应了招标文件，就必须按照招投标文件约定去履行义务。因此，当招标清单单价与实际不相符时，是由中标人买单。
如果中标价与实际施工价之间差额控制在10%之内，甲乙双方进行协商，有可能达成协议，通过签订补充合同来妥善解决。
但是，你所反映的是主要工序出了问题，并且金额占比很大，相信应该远远超过10%，在这种情况下，甲方不可能进行项目的变更调整。
如果以上问题招标清单工程量时准确的话，这样问题需要从招标清单的项目特征、人工、材料、机械四方面具体分析。
1、招标工程量清单项目描述特征不准确：工程量清单项目特征的描述是投标报价的前提，除清单工程量之外，项目特征的描述是报价重要的依据，施工单位以项目特征描述进行投标价格的编制，如果招标清单***征描述有误，或者将重要的特征省略导致投标报价有误，那这样的原因导致报价过低，根据招标文件由建设单位（或委托的咨询单位）对文件准确性负责的特点，施工单位可以根据现场或者实际的施工特征进行费用的测算，并可以要求重新编制清单单价。
2、清单项目特征描述没有问题，且非常的准确：以上问题是说，因为施工工序存在重大的的问题，招标单位及施工单位都没有见过，导致施工价格有非常大的偏差，这中间主要是人工费、材料费、机械费的综合组成的费用偏差。具体分析是，人工费是否有政策性文件调整，如果有相关文件，人工费可以调整，如果没有，则没有调整的理由，材料费有两点，第一，招标文件是否将此部分材料试做为暂定价，如果为材料暂定价，那么可以根据实际情况调整，如果不是暂定价，现场市场价是否超过清单规定的调整范围，如超过可以调整。三，机械费是否有调整的约定。
3、按照以上的问题，如果招标单位在招标的过程中，已经给定了该项的单价费用，并且施工单位也相应了该项的单价，作为清单招标来讲，这项应可以视作暂定价，应按合同中做出相应约定的调整方式
总之，清单报价，要综合招标文件的清单工程量及项目特征的描述，对特殊的施工要特别的标注。施工单位按招标清单中项目特征描述报价，如图纸与描述的特征不一致，以招标文件项目特征描述为报价依据。招标文件的编制由建设单位或者（委托的咨询单位）对成果负责，施工单位对报价成果负责，这是清单报价中有明确说的，并且施工单位报价要综合一定的风险费用。然而新清单中并不一时所有的风险均有施工单位承担，对于符合相关内容的风险，建设单位也应承担相应的风险费用。
